也幸亏第二旅和第三旅的参谋们，根据南京的城防地图，很仔细的推敲了接管南京的方案，但就是这样，也闹出了不少乱子，出现了各种各样的情况。
林良珺和林德阳分别让军法官的人在街头巡逻，又抓了几个不守军纪的士兵，这才算是初步恢复了秩序。
关押甄别投诚官员和士兵，处理战场，清理南京城内的尸体，维持治安，控制各部衙门，等到三月二十日的，南京城终于安定下来。
三月二十日，李时珍从苏州府带领学徒五十人进入南京城。
林良珺干脆直接将南京城中央的旧宫，也就是明故宫拿出来，交给李时珍来做医院。
李时珍倒是也没顾这些，他带着学徒立刻对南京城内的疫病情况进行调查，迅速扑灭了几次小型瘟疫。
接着，李时珍巨大的号召力，让整个南京城懂得医术的人都来皇宫报道，对于战争中受伤的士兵和市民也开放了义诊。
至于东南新军，这一次整个东南新军进攻南京的战役中，仅仅阵亡三人，伤五百人。
这伤亡的士兵，没有一个人是在攻城的时候受伤的，全部都是维持治安的战斗中伤亡的。
三月二十一日，已经被各种民政事务忙的焦头烂额的林良珺，终于等来了救星。
“徐参赞！”
看到徐渭的长胡子，林良珺立刻惊喜的说道：“您怎么来南京了？大都督来了吗？”
徐渭摇头说道：“大都督在上海等你们呢，大都督派我来，接任南京城的军务民政。”
听到徐渭这么说，林良珺立刻大喜过望说道：“终于把您盼来了！大都督能派您来太好了！我这就就交接，然后立刻去上海！”
徐渭说道：“传大都督军令。”
林良珺立刻站直身体，徐渭拿出文件说道：
“第二旅，第三旅攻克南京，所有士兵嘉奖银元五枚，各级军官多奖励银元五枚。官兵皆受旌表，银元已经运到南京立刻发放，旌表等战后再发放。”
“第二旅，第三旅各级军官叙功一份，每个连队推荐一名战斗英雄，参加下一轮军校进修。”
“从第二旅和第三旅中各抽调一千人，组成南京卫戍第五旅的骨干，由徐渭在南京招募第五旅士兵。”
“允许第二旅在南京补充吸收兵员三千人，第三旅在南京补充吸收兵员三千人。”
“接到命令开始，休整三日，第二旅，第三轮所部向上海开拔。”
林良珺立刻喜滋滋的接过军令。
紧接着徐渭又拿出另外一份政令。
“大都督府政令。”
“任命徐渭为南直隶巡抚，接管南京城防务和政务。”
林良珺仿佛解脱了一般，立刻将南京城内所有的政务都移交给了徐渭。
他自己则忙着整编士兵，另外还要和第三旅的林德阳抢夺兵源。
虽然在刚刚的攻打南京作战中，两个旅配合默契。
但是此时两个旅已经是竞争关系，主要是这扩军的兵源，好的士兵自然是大家都要抢。
双方争抢的，就是高拱训练的一千南京新军。
两人都从熊况那边拿到了新军军官的名单，然后开始了疯狂的抢人大战。
高务观这种，有起义功劳，本人又是新军中尖子生的，自然被双方轮流招揽。
最后高务观还是带领部下加入了第二旅，林良珺立刻任命他为参谋，并且许诺一定会让他去军校进修。
那些南京新军中的寒门子弟，加入东南新军更是没有任何心理压力。
抢完了新军之后，剩下的就是南京各部队的士兵了。
不过这些士兵很多都超过了服役年龄，还有不少都营养不良，也有一些干脆就是城里的混混无赖，是为了投机取巧而参军的。
挑挑拣拣，南京城号称三万大军，竟然连五千合格的兵源都凑不齐！
后来还是徐渭允许他们在城内市民中招募士兵，这才凑齐了六千人。
三月二十四日，休整和整编完毕的第二旅，第三轮准备开拔，被圈在临淮侯府中的临淮侯世子李言恭，找到了李廷竹。
“爹，我想清楚了，我要从军。”
临淮侯一家没有什么劣迹，他们复爵之后一直本本分分，所以林良珺只是将他们圈在府中禁止出入，并没有限制他们在府内的自由。
“从军？从什么军？”李廷竹被上次爆炸惊吓，至今脑子依然嗡嗡的，他一时没有反应过来。
“等等，你要从贼！”
李言恭说道：“父亲，南京您也守了，我们临淮侯必定要被除爵了，君恩您也算是报了。”
“儿子不孝，想要走自己的路。”
说完，李言恭对着李廷竹跪拜行礼，紧接着他走到侯府门口，对着守卫侯府大门的士兵喊道：
“我是南京新军学堂的军官，我要从军！”
侯府大门打开，一个军官看向李言恭，这个人赫然就是熊况。
“熊兄！”
熊况已经换上了东南新军的延平蓝色军官，他对着李言恭笑着说道：“我本来是要向李兄辞行的，没想到我们又要同路而行了，高兄已经加入第二旅了！”